酵母蛋白表达系统

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近年来,毕赤酵母表达系统开始崭露头角,Eptinezumab是首款采用毕赤酵母表达的抗体药物。毕赤酵母不仅拥有原核生物表达系统的优势,本文详细讲述了酵母表达表现型Mut+和Muts,酵母表达同源重组方式整合分析,酵母表达载体选择及其与大肠杆菌表达系统的区别,酵母表达原理及酵母蛋白表达实验SOP。

酵母蛋白表达系统

酵母表达系统是真核表达蛋白 的常用系统 之一,具有真核表达系统的许多优点:如生产成本低、发酵周期短、易于培养、操作简单方便、可大规模生产、基因遗传稳定等;它还有哺乳动物细胞表达系统的诸多优势,如蛋白加工、折叠、翻译后修饰等。因此,毕赤酵母受到越来越多研究机构和医药生产企业的青睐。特别是与CHO细胞相比,毕赤酵母有诸多优势,首先毕赤酵母与CHO细胞都是真核细胞,拥有高等真核表达系统的诸多优点;其次,毕赤酵母构建细胞株更快,不需要耗时的病毒清除验证步骤,极大缩短了研发周期;最后,从生产方面而言,毕赤酵母有更快、更容易、更便宜、更高产量的特点,还可以高密度、大规模培养,大幅降低抗体药物的生产成本。(下文所提到的酵母蛋白表达均为巴斯德毕赤酵母)

酵母蛋白表达与大肠杆菌表达的区别

酵母蛋白表达与大肠杆菌表达有部分不同,大肠杆菌表达只需将质粒/载体转入到宿主菌体内,其载体携带复制起始点随着宿主染色体的复制而复制,可以稳定存在。而酵母表达相对复杂,设计的质粒/载体均不带有酵母自身复制起始点,因此如果直接导入到宿主菌中,不能稳定存在。所以必须将质粒/载体线性化,以同源重组的方式与宿主菌的染色体进行整合,这样外源基因才能够稳定存在,而且同源重组一旦形成会很稳定,在通过后期的筛选排除没有整合成功的质粒/载体和宿主菌,挑选整合成功并能够高表达的重组转化子,某种程度上与哺乳动物稳定细胞系构建原理类似。

毕赤酵母蛋白表达系统构成

该部分内容可参照本公众号的文章:酵母表达外源蛋白原理

毕赤酵母表达系统机制/原理

毕赤酵母能够高效的表达外源基因,是因为其具有强启动子乙醇氧化酶启动子(AOX1和AOX2)。AOX1和AOX2及其产生的Muts和Mut+表现型前文已经叙述过。AOX1受甲醇的诱导和葡糖糖或甘油的抑制。毕赤酵母表达的外源基因位于酵母染色体上,通过把构建的质粒/载体线性化(主要采用酶切),通过同源重组的方式整合到启动子AOX的下游,一般是插入到5’AOX启动子和转录终止子信号之间的单克隆位点。

①毕赤酵母同源重组的方式

质粒/载体和酵母表达基因图谱

图1:载体图谱:5'AOX1启动子位点,

转录终止子TT,3'AOX1位点

图2:酵母宿主菌基因

※质粒载体上的PAOX位点(PAOX启动子)或PAOX转录终止子TT或下游3’AOX1三个位点与酵母宿主菌基因发生同源重组

在酵母宿主菌基因组的下游或者上游插入一个或多个质粒载体基因。如插入的质粒载体不破坏酵母宿主菌基因本身的AOX1,那么重组转化子的表现型不变为Mut+,反之为Muts

图3:重组质粒插入3’AOX1

※质粒/载体基因替换酵母宿主菌的AOX1位点

酵母宿主菌的AOX1启动子位点被质粒/载体基因完全替代,原有的酵母AOX1启动子被破坏,表现型为Muts,取代其的是质粒/载体基因组上的PAOX,目的基因,HIS4表达序列。取代事件发生的概率较基因插入事件要小。

图4:AOX1位点被替换

※多拷贝插入

简单来说就是质粒/载体基因的多次插入(插入到酵母宿主菌基因组上),自发概率很低

酵母表达转化方法比较

培养好的酵母宿主菌和构建好的质粒进行同源重组的转化方法有以下几种,都是基于线性化质粒/载体之后,线性化是转化的第一步,用限制酶酶切。

※转化方法

转化方法 转化效率 是否会多拷贝整合 操作
原生质体法 10^5 操作复杂
电穿孔法(电击) 10^5 操作方便
PEG诱导转化 10^3 操作方便

毕赤酵母表达系统主要优点

①毕赤酵母含有特有的AOX1强效启动子,它在甲醇中表达的AOX1基因的mRNA占细胞总mRNA的5%、AOX蛋白占细胞总蛋白的30%-40%,表达外源蛋白产量是酿酒酵母的10-100倍,并通过甲醇即可调控基因表达。

②毕赤酵母的表达水平高,最高表达量已经突破20g/L,而CHO细胞的产量普遍在3g/L。

③毕赤酵母作为单细胞微生物,具有和大肠杆菌、酿酒酵母一样简单的操作。外源基因可以整合到毕赤酵母染色体上,随染色体复制而复制,传代过程中非常稳定、不易丢失。

④毕赤酵母的发酵工艺成熟,易放大。目前已经有大规模工业化高密度生产的发酵工艺,且细胞干重达150g/L以上,表达重组蛋白已成功放大到80,000L。

⑤毕赤酵母发酵使用的华体会体育最新地址 成本低廉,碳源为甘油或葡萄糖,其余为甲醇、氨水或硝酸盐等氮源以及少量无机盐,华体会体育最新地址 中不含蛋白,可以简化外源蛋白的下游纯化过程。

⑥毕赤酵母分泌效率较高,对于带有指导分泌信号肽序列的外源目的基因,毕赤酵母可以直接将目的蛋白分泌到发酵液中,有利于后续分离纯化。

作为真核表达系统,毕赤酵母具有真核生物的亚细胞结构,具有糖基化、脂肪酰化、蛋白磷酸化等翻译后修饰加工功能,同时没有酿酒酵母的过度糖基化等缺点。

酵母蛋白表达影响因素

①启动子的选择

酵母表达系统常用的是醇氧化酶基因启动子PAOX,具有强诱导性和强启动性。PGAP启动子是毕赤酵母中克隆到的一个组成型启动子,在PGAP控制下,LabZ基因表达比甲醇诱导下PAOX表达量更高,且不需要甲醇诱导,放大工艺更加简便。

②目的基因的优化

目的基因决定表达成败的首要因素。由于密码子的简并性,不同的表达系统都有其特定的偏爱密码子。所以在基因合成时便要进行密码子的优化,换掉稀有密码子并进行mRNA结构优化,提高蛋白表达量,防止蛋白不表达或表达量低。

③影响蛋白分泌的因素

如果蛋白本身不易分泌,即不适分泌表达,可尝试在用酿酒酵母的α-AMF(交配因子)信号肽序列,对胰岛素、凝血因子等小分子有用,在α-AMF和目的基因之间插入间隔肽能够提高目的蛋白的表达水平。信号肽会影响蛋白分泌表达的水平。此外,其他影响因素还包括重组转化子的筛选,遗传背景影响,蛋白的稳定性影响等。

酵母蛋白表达实验操作(SOP)

本文的酵母蛋白表达是简单叙述实验的主体流程,详细的标准操作流程见蛋本公众号中另一篇文章: 酵母蛋白表达步骤(SOP)

感受态细胞的制备

对质粒进行不同方式的转化需要制备不同的感受态细胞状态。且酵母表达的感受态细胞最好现做现用,感受态对转化效率有很大影响。在酵母表达SOP中包括电转,PEG1000和原生质法三种转化的感受态细胞制备方法,具体的制备方法可参考本公众号的酵母感受态细胞的制备部分。

酵母的转化

包括三个转化方法操作步骤:原生质法转化,电转化,PEG1000

阳性转化子的筛选与蛋白表达

对转化后的酵母宿主菌进行筛选,筛选出成功实现同源重组的转化子,进行诱导表达。详细的标准操作流程见蛋本公众号中另一篇文章: 酵母蛋白表达步骤(SOP)

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